《细胞》å‘表医学研究院肖é”è¯¾é¢˜ç»„æœ€æ–°ç ”ç©¶æˆæžœ

教育作者:武汉通日期:2023-2-22点击:20

新闻网讯(通讯员å¶é›¯ï¼‰6月27日,Cell(《细胞》)以长文(Article)形å¼åœ¨çº¿å‘表了我校医学研究院ã€å…ç–«ä¸Žä»£è°¢å‰æ²¿ç§‘学中心肖é”研究员与美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)付å‘ä¸œæ•™æŽˆè¯¾é¢˜ç»„çš„æœ€æ–°ç ”ç©¶æˆæžœã€‚

论文题为“Pervasive Chromatin-RNA Binding Protein Interactions Enable RNA-based Regulation of Transcriptionâ€ã€ŠRNA结åˆè›‹ç™½å¹¿æ³›åœ°ä¸ŽæŸ“色质相互作用以实现RNAä»‹å¯¼çš„è½¬å½•è°ƒæŽ§ã€‹ã€‚è‚–é”æ˜¯è¯¥æ–‡çš„å…±åŒç¬¬ä¸€ä½œè€…和通讯作者。

RNA结åˆè›‹ç™½åœ¨è½¬å½•åŽçš„剪接加工ã€ä¿®é¥°ã€è½¬è¿ã€ç»†èƒžå®šä½ã€ç¨³å®šæ€§ã€ç¿»è¯‘å’Œé™è§£ç­‰RNAä»£è°¢è¿‡ç¨‹ä¸­å‘æŒ¥ç€é‡è¦çš„调控功能,但其在转录水平的调控功能和机制尚未有系统的研究。通过ChIP-seq(染色质å…疫沉淀测åºï¼‰æŠ€æœ¯å¤§è§„模检测了63个有细胞核定ä½çš„RNA结åˆè›‹ç™½ä¸ŽæŸ“色质的相互作用,肖é”研究员等æ„外地å‘现约60%çš„RNA结åˆè›‹ç™½ä¸ŽæŸ“色质有广泛的相互作用,并且富集在基因å¯åЍå­å’Œå¢žå¼ºå­åŒºåŸŸã€‚

æ›´ä»¤äººæƒŠè®¶çš„æ˜¯ï¼Œè¯¥ç ”ç©¶è™½ç„¶åªæ£€æµ‹äº†äººç±»åŸºå› ç»„中一å°éƒ¨åˆ†çš„RNA结åˆè›‹ç™½ï¼ˆ<5%),å´å‘现约40%的活性染色质区域和约70%的活性å¯åЍå­åŒºåŸŸéƒ½å­˜åœ¨RNA结åˆè›‹ç™½çš„特异性结åˆï¼Œè¿™æç¤ºRNA结åˆè›‹ç™½åœ¨æŸ“色质水平存在ç€å¹¿æ³›çš„功能和作用。éšåŽï¼Œé€šè¿‡GRO-seq(Global Nuclear Run-On测åºï¼‰å®žéªŒè¯å®žï¼Œéƒ¨åˆ†RNA结åˆè›‹ç™½å…·æœ‰å¼ºçƒˆçš„转录调控作用。

该研究还é‡ç‚¹é˜é‡Šäº†RNA结åˆè›‹ç™½RBM25通过调控转录因å­YY1与染色质的结åˆï¼Œè¿›è€Œè°ƒæŽ§æŸ“è‰²è´¨ç»“æž„å’Œè½¬å½•æ¿€æ´»ä¸ŽæŠ‘åˆ¶çš„åˆ†å­æœºåˆ¶ï¼Œå…¨é¢å±•示了特异性的RNA结åˆè›‹ç™½ä»‹å¯¼çš„转录因å­YY1的功能调控作用。整个å‘现æå‡ºäº†RNA结åˆè›‹ç™½ä½œä¸ºè½¬å½•å› å­æˆ–辅助因å­è°ƒæŽ§è½¬å½•的新概念,也开辟了RNA结åˆè›‹ç™½åŠŸèƒ½ç ”ç©¶çš„æ–°é¢†åŸŸã€‚

è‚–é”研究员是医学研究院2017年引进的优秀归国人æ‰ï¼Œæœ¬ç§‘å’Œåšå£«æ¯•业于武汉大学生命科学学院,åšå£«å’Œåšå£«åŽæœŸé—´å¸ˆä»ŽRNA研究领域专家UCSD的付å‘东教授,至今一直专注于自己热爱的RNA生物学和功能基因组学领域开展研究工作,并å–得了一系列é‡è¦çš„æˆæžœã€‚è¿‘å¹´æ¥ï¼Œè‚–é”研究员作为第一作者和通讯作者在Cell(1篇),Nature(2篇)和Molecular Cell(2篇)等顶尖期刊上å‘表了多篇高水平研究论文。

美国加州大学圣地亚哥分校陈加余åšå£«å’Œæ¢å¾å®‡åšå£«ä¸ºè¯¥è®ºæ–‡å…±åŒç¬¬ä¸€ä½œè€…,付å‘东教授为共åŒé€šè®¯ä½œè€…,共åŒä½œè€…包括武汉大学周宇教授和罗大æžå‰¯æ•™æŽˆï¼Œæ¸…åŽå¤§å­¦é²å¿—教授ã€å¼ å¥‡ä¼Ÿæ•™æŽˆå’Œé™ˆé˜³åŠ©ç†ç ”究员,厦门大学刘文教授,美国MIT Christopher Burge教授,UCSD Gene Yeo教授,康涅狄格大学Brenton Graveley教授和加拿大蒙特利尔大学Eric Lecuyeræ•™æŽˆã€‚è¯¥å·¥ä½œå¾—åˆ°äº†å›½å®¶è‡ªç„¶ç§‘å­¦åŸºé‡‘ä»¥åŠæ­¦æ±‰å¤§å­¦â€œåŒä¸€æµâ€äººæ‰ç§‘ç ”å¯åЍç»è´¹çš„资助。

原文链接:https://doi.org/10.1016/j.cell.2019.06.001

(供图:医学研究院  编辑:陈丽霞)